北京财税研究院2007年开始，与财政部科研所研究生部共同招收税务、财务两个方向的在职硕士研究生班，培养高水平的财税管理人才。研究生班基础课程由财科所负责，专业课程由北京财税研究院负责。2010年与北京大学合作，举办公司金融管理高级研修班，师资、教材全部由北京财税研究院负责。
